Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF1Q9HCE7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMURF1Q9HCE7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMURF1Q9HCE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMURF1Q9HCE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms