Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C20orf27Q9GZN8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C20orf27Q9GZN8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C20orf27Q9GZN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C20orf27Q9GZN8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C20orf27Q9GZN8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms