Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF3Q9GZM5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YIPF3Q9GZM5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIPF3Q9GZM5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF3Q9GZM5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms