Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMIM2Q9BVW6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM2Q9BVW6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM2Q9BVW6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM2Q9BVW6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms