Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOL4Q9BPW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL4Q9BPW4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL4Q9BPW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOL4Q9BPW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms