Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01600Q96MT4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01600Q96MT4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01600Q96MT4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms