Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3KBP1Q96B97 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3KBP1Q96B97 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3KBP1Q96B97 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3KBP1Q96B97 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms