Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBASH3BQ8TF42 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBASH3BQ8TF42 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBASH3BQ8TF42 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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