Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATAD3CQ5T2N8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATAD3CQ5T2N8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATAD3CQ5T2N8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms