Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD3Q5T2D3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUD3Q5T2D3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUD3Q5T2D3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms