Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C6orf141Q5SZD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C6orf141Q5SZD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C6orf141Q5SZD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C6orf141Q5SZD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms