Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COLEC12Q5KU26 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COLEC12Q5KU26 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COLEC12Q5KU26 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms