Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB30Q15771 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB30Q15771 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAB30Q15771 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB30Q15771 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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