Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR6A1Q15406 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR6A1Q15406 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR6A1Q15406 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR6A1Q15406 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms