Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SYNGR2-208ENST00000591770 864 ntTSL 214.84□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 SYNGR2-209ENST00000592456 3036 nt12.98□□□□□ -0.331e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 PKMYT1-217ENST00000575040 605 ntTSL 312.79□□□□□ -0.361e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 TIMM21-206ENST00000584925 590 ntTSL 212.01□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 TIMM21-203ENST00000579071 821 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.291e-10■■■■■ 58.9
EFTUD2Q15029 ING5-211ENST00000493261 543 ntTSL 210.41□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 58.8
EFTUD2Q15029 MRPL55-225ENST00000465268 848 ntTSL 213.97□□□□□ -0.171e-24■■■■■ 58.7
EFTUD2Q15029 LPCAT4-202ENST00000562404 577 ntTSL 310.52□□□□□ -0.738e-9■■■■■ 58.7
EFTUD2Q15029 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 215.54■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 ARPC1A-202ENST00000432786 1516 ntTSL 514.61□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 ARPC1A-204ENST00000471960 741 ntTSL 313.19□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 RRP12-207ENST00000479481 3271 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 RRP12-201ENST00000315563 4038 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 RRP12-203ENST00000414986 4242 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 ALDOA-218ENST00000566146 365 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.036e-14■■■■■ 58.6
EFTUD2Q15029 PHKG2-205ENST00000563607 726 ntTSL 214.25□□□□□ -0.133e-16■■■■■ 58.5
EFTUD2Q15029 FDXR-215ENST00000581969 568 ntTSL 419.45■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 58.4
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-215ENST00000543359 627 ntTSL 312.33□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 58.4
EFTUD2Q15029 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 58.4
EFTUD2Q15029 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-10■■■■■ 58.4
EFTUD2Q15029 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-10■■■■■ 58.4
EFTUD2Q15029 RPS16-203ENST00000595386 1035 ntTSL 215.26■□□□□ 0.033e-17■■■■■ 58.3
EFTUD2Q15029 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 513.99□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 58.2
EFTUD2Q15029 AURKB-213ENST00000584972 739 ntTSL 310.32□□□□□ -0.763e-10■■■■■ 58.2
EFTUD2Q15029 NUDC-204ENST00000484772 607 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-10■■■■■ 58.1
EFTUD2Q15029 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.067e-7■■■■■ 58
EFTUD2Q15029 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 58
EFTUD2Q15029 HSPE1-205ENST00000465573 639 ntTSL 218.3■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 58
EFTUD2Q15029 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.237e-7■■■■■ 58
EFTUD2Q15029 SHMT2-233ENST00000557529 1369 ntTSL 212.69□□□□□ -0.382e-9■■■■■ 58
EFTUD2Q15029 SCAF8-204ENST00000461219 677 ntTSL 519.57■□□□□ 0.724e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.074e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.294e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 TMEM68-208ENST00000520414 639 ntTSL 512.18□□□□□ -0.464e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.634e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 SCAF8-205ENST00000464628 468 ntTSL 510.16□□□□□ -0.784e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.54e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 BRD8-221ENST00000489351 553 ntTSL 54.14□□□□□ -1.754e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.824e-11■■■■■ 57.9
EFTUD2Q15029 MAPKAPK2-204ENST00000493447 241 ntTSL 311.43□□□□□ -0.583e-10■■■■■ 57.8
EFTUD2Q15029 ANKLE2-211ENST00000545623 1288 ntTSL 37.92□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ANKLE2-205ENST00000538591 886 ntTSL 37.88□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ANKLE2-204ENST00000535036 741 ntTSL 56.78□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-203ENST00000435366 1499 ntTSL 215.88■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-204ENST00000438751 670 ntTSL 315.85■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-202ENST00000433764 569 ntTSL 415.65■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-208ENST00000456350 634 ntTSL 415.59■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-210ENST00000566203 915 ntTSL 414.92□□□□□ -0.028e-7■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-207ENST00000455178 395 ntTSL 514.16□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 MMP24-AS1-212ENST00000635104 1227 ntTSL 511.35□□□□□ -0.598e-7■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.346e-9■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.426e-9■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-9■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.096e-9■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP12-209ENST00000497085 1641 ntTSL 1 (best)4.75□□□□□ -1.656e-9■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP12-208ENST00000493008 2334 ntTSL 24.55□□□□□ -1.686e-9■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP12-207ENST00000492028 3227 ntTSL 1 (best)3.6□□□□□ -1.836e-9■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.866e-9■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 GCN1-205ENST00000548821 504 ntTSL 39.07□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 57.7
EFTUD2Q15029 RPL8-213ENST00000533397 730 ntTSL 215.56■□□□□ 0.083e-13■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.882e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.772e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.712e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM132A-207ENST00000537065 324 ntTSL 324.71■■□□□ 1.552e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-229ENST00000567928 545 ntTSL 224.46■■□□□ 1.512e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SRRM1-222ENST00000596378 2314 ntTSL 1 (best)23.76■■□□□ 1.392e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-220ENST00000565269 576 ntTSL 423.71■■□□□ 1.392e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM132A-213ENST00000544065 990 ntTSL 223.61■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 DGKZ-222ENST00000533376 496 ntTSL 523.59■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.352e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM132A-211ENST00000540276 514 ntTSL 323.33■■□□□ 1.332e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.292e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 FAM117A-206ENST00000506156 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.95■■□□□ 1.262e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CNOT7-204ENST00000518885 477 ntTSL 322.83■■□□□ 1.252e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ENGASE-204ENST00000578419 1381 ntTSL 222.56■■□□□ 1.22e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-216ENST00000564294 1046 ntTSL 221.93■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MYL5-203ENST00000503300 1780 ntTSL 221.8■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-218ENST00000564679 589 ntTSL 221.8■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.973e-10■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM132A-212ENST00000543732 742 ntTSL 321.08■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 ITSN1-220ENST00000451686 501 ntTSL 420.79■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MAN2A2-221ENST00000560451 5124 ntTSL 1 (best)20.76■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 DGKZ-212ENST00000527674 1785 ntTSL 220.63■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 DOK4-206ENST00000563483 568 ntTSL 320.34■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 COPS7A-218ENST00000543939 1728 ntTSL 320.27■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NOL12-206ENST00000493862 1011 ntTSL 520.03■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 MLST8-225ENST00000566653 584 ntTSL 219.98■□□□□ 0.792e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 BOLA3-205ENST00000484655 2982 ntTSL 1 (best)19.74■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 57.6
EFTUD2Q15029 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.742e-8■■■■■ 57.6
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