RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.12	■■■■■ 7.05
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.79	■■■■■ 6.04
CNOT7-204	ENST00000518885	ABCC9	O60706	1549 aa		51.91	■■■■■ 5.9
CNOT7-204	ENST00000518885	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.9	■■■■■ 5.58
CNOT7-204	ENST00000518885	NACAD	O15069	1562 aa		49.74	■■■■■ 5.55
CNOT7-204	ENST00000518885	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.58	■■■■■ 5.53
CNOT7-204	ENST00000518885	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.34	■■■■■ 5.49
CNOT7-204	ENST00000518885	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.15	■■■■■ 5.46
CNOT7-204	ENST00000518885	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.97	■■■■■ 5.43
CNOT7-204	ENST00000518885	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.56	■■■■■ 5.36
CNOT7-204	ENST00000518885	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.42	■■■■■ 5.34
CNOT7-204	ENST00000518885	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.22	■■■■■ 5.31
CNOT7-204	ENST00000518885	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.04	■■■■■ 5.28
CNOT7-204	ENST00000518885	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.95	■■■■■ 5.27
CNOT7-204	ENST00000518885	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		47.85	■■■■■ 5.25
CNOT7-204	ENST00000518885	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.07	■■■■■ 5.13
CNOT7-204	ENST00000518885	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.95	■■■■■ 5.11
CNOT7-204	ENST00000518885	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.75	■■■■■ 5.07
CNOT7-204	ENST00000518885	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.94	■■■■■ 4.94
CNOT7-204	ENST00000518885	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.92	■■■■■ 4.94
CNOT7-204	ENST00000518885	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.86	■■■■■ 4.93
CNOT7-204	ENST00000518885	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.82	■■■■■ 4.93
CNOT7-204	ENST00000518885	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.79	■■■■■ 4.92
CNOT7-204	ENST00000518885	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.62	■■■■■ 4.89
CNOT7-204	ENST00000518885	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.53	■■■■■ 4.88
CNOT7-204	ENST00000518885	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.48	■■■■■ 4.87
CNOT7-204	ENST00000518885	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.46	■■■■■ 4.87
CNOT7-204	ENST00000518885	WIZ	O95785	1651 aa		44.97	■■■■■ 4.79
CNOT7-204	ENST00000518885	ERCC6	Q03468	1493 aa		44.91	■■■■■ 4.78
CNOT7-204	ENST00000518885	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.86	■■■■■ 4.77
CNOT7-204	ENST00000518885	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.75	■■■■■ 4.75
CNOT7-204	ENST00000518885	NES	P48681	1621 aa		44.75	■■■■■ 4.75
CNOT7-204	ENST00000518885	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.57	■■■■■ 4.73
CNOT7-204	ENST00000518885	CUX2	O14529	1486 aa		44.57	■■■■■ 4.73
CNOT7-204	ENST00000518885	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.51	■■■■■ 4.72
CNOT7-204	ENST00000518885	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.51	■■■■■ 4.72
CNOT7-204	ENST00000518885	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.25	■■■■■ 4.67
CNOT7-204	ENST00000518885	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.21	■■■■■ 4.67
CNOT7-204	ENST00000518885	CFTR	P13569	1480 aa		44.15	■■■■■ 4.66
CNOT7-204	ENST00000518885	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.02	■■■■■ 4.64
CNOT7-204	ENST00000518885	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.01	■■■■■ 4.64
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.99	■■■■■ 4.63
CNOT7-204	ENST00000518885	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.99	■■■■■ 4.63
CNOT7-204	ENST00000518885	WDR62	O43379	1518 aa		43.84	■■■■■ 4.61
CNOT7-204	ENST00000518885	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.78	■■■■■ 4.6
CNOT7-204	ENST00000518885	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.57	■■■■■ 4.57
CNOT7-204	ENST00000518885	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.5	■■■■■ 4.55
CNOT7-204	ENST00000518885	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
CNOT7-204	ENST00000518885	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.34	■■■■■ 4.53
CNOT7-204	ENST00000518885	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CNOT7-204	ENST00000518885	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.17	■■■■■ 4.5
CNOT7-204	ENST00000518885	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.12	■■■■■ 4.49
CNOT7-204	ENST00000518885	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.81	■■■■■ 4.44
CNOT7-204	ENST00000518885	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
CNOT7-204	ENST00000518885	CUX1	P39880	1505 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CNOT7-204	ENST00000518885	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.43
CNOT7-204	ENST00000518885	SOGA1	O94964	1423 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CNOT7-204	ENST00000518885	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CNOT7-204	ENST00000518885	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CNOT7-204	ENST00000518885	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CNOT7-204	ENST00000518885	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CNOT7-204	ENST00000518885	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.55	■■■■■ 4.4
CNOT7-204	ENST00000518885	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
CNOT7-204	ENST00000518885	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.38	■■■■■ 4.38
CNOT7-204	ENST00000518885	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CNOT7-204	ENST00000518885	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CNOT7-204	ENST00000518885	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CNOT7-204	ENST00000518885	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CNOT7-204	ENST00000518885	FBLN2	P98095	1184 aa		42.22	■■■■■ 4.35
CNOT7-204	ENST00000518885	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
CNOT7-204	ENST00000518885	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CNOT7-204	ENST00000518885	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CNOT7-204	ENST00000518885	CHD1	O14646	1710 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CNOT7-204	ENST00000518885	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CNOT7-204	ENST00000518885	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
CNOT7-204	ENST00000518885	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CNOT7-204	ENST00000518885	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CNOT7-204	ENST00000518885	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.97	■■■■■ 4.31
CNOT7-204	ENST00000518885	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.91	■■■■■ 4.3
CNOT7-204	ENST00000518885	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.91	■■■■■ 4.3
CNOT7-204	ENST00000518885	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.91	■■■■■ 4.3
CNOT7-204	ENST00000518885	ARHGEF11	O15085	1522 aa		41.88	■■■■■ 4.29
CNOT7-204	ENST00000518885	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.79	■■■■■ 4.28
CNOT7-204	ENST00000518885	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.75	■■■■■ 4.27
CNOT7-204	ENST00000518885	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.74	■■■■■ 4.27
CNOT7-204	ENST00000518885	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.71	■■■■■ 4.27
CNOT7-204	ENST00000518885	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.68	■■■■■ 4.26
CNOT7-204	ENST00000518885	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.58	■■■■■ 4.25
CNOT7-204	ENST00000518885	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.53	■■■■■ 4.24
CNOT7-204	ENST00000518885	NUP160	Q12769	1436 aa		41.49	■■■■■ 4.23
CNOT7-204	ENST00000518885	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.48	■■■■■ 4.23
CNOT7-204	ENST00000518885	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.42	■■■■■ 4.22
CNOT7-204	ENST00000518885	CUL7	Q14999	1698 aa		41.36	■■■■■ 4.21
CNOT7-204	ENST00000518885	IGF1R	P08069	1367 aa		41.35	■■■■■ 4.21
CNOT7-204	ENST00000518885	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.21	■■■■■ 4.19
CNOT7-204	ENST00000518885	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.15	■■■■■ 4.18
CNOT7-204	ENST00000518885	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.13	■■■■■ 4.17
CNOT7-204	ENST00000518885	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.09	■■■■■ 4.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 273.8 ms