Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF1Q14990 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODF1Q14990 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODF1Q14990 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms