Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN5AQ14524 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN5AQ14524 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN5AQ14524 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SCN5AQ14524 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SCN5AQ14524 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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