Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN5AQ14524 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN5AQ14524 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN5AQ14524 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN5AQ14524 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN5AQ14524 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SCN5AQ14524 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SCN5AQ14524 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCN5AQ14524 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCN5AQ14524 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCN5AQ14524 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCN5AQ14524 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms