Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTAN1Q13813 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTAN1Q13813 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTAN1Q13813 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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