Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.753e-13■■■■■ 41.6
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TARDBPQ13148 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 517.03■□□□□ 0.323e-13■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 35.53□□□□□ -1.523e-13■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 AK2-213ENST00000551979 581 ntTSL 213.31□□□□□ -0.281e-12■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 AK2-211ENST00000548559 530 ntTSL 49.94□□□□□ -0.821e-12■■■■■ 41.6
TARDBPQ13148 AK2-214ENST00000626911 160 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-12■■■■■ 41.6
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TARDBPQ13148 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 ANKZF1-226ENST00000496346 1290 ntTSL 212.53□□□□□ -0.42e-8■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 ANKZF1-210ENST00000461731 1566 ntTSL 212.5□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 ANKZF1-213ENST00000465550 2793 ntTSL 210.2□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 41.5
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TARDBPQ13148 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.127e-11■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.498e-9■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 316■□□□□ 0.158e-9■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 DNAJB6-213ENST00000468928 900 ntTSL 314.42□□□□□ -0.18e-9■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 DNAJB6-216ENST00000487480 5173 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 41.5
TARDBPQ13148 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 41.4
TARDBPQ13148 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.826e-8■■■■■ 41.4
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TARDBPQ13148 BSDC1-213ENST00000530753 571 ntTSL 417.74■□□□□ 0.432e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-214ENST00000530876 570 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-202ENST00000373520 1630 ntTSL 215.39■□□□□ 0.052e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-210ENST00000527163 567 ntTSL 514.08□□□□□ -0.162e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-211ENST00000527513 576 ntTSL 514.08□□□□□ -0.162e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.22e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.222e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-212ENST00000530485 482 ntTSL 512.45□□□□□ -0.422e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-216ENST00000533084 564 ntTSL 311.86□□□□□ -0.512e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-12■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 BSDC1-204ENST00000444377 2925 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.672e-12■■■■■ 41.3
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TARDBPQ13148 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 41.3
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TARDBPQ13148 NUP188-205ENST00000477069 2941 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.694e-11■■■■■ 41.3
TARDBPQ13148 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.784e-11■■■■■ 41.3
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TARDBPQ13148 CYTOR-201ENST00000331944 529 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.494e-12■■■■■ 41.3
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TARDBPQ13148 CYTOR-206ENST00000414030 718 ntTSL 36.37□□□□□ -1.394e-12■■■■■ 41.3
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TARDBPQ13148 CDC25B-206ENST00000467519 1960 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.296e-10■■■■■ 41.2
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TARDBPQ13148 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 41.2
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TARDBPQ13148 MARK3-207ENST00000553942 2298 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 41.2
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TARDBPQ13148 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-9■■■■■ 41.1
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