Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NUP160Q12769 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NUP160Q12769 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
NUP160Q12769 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP160Q12769 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP160Q12769 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP160Q12769 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
NUP160Q12769 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
NUP160Q12769 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NUP160Q12769 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
NUP160Q12769 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
NUP160Q12769 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.05■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NUP160Q12769 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
NUP160Q12769 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms