Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 POT1YIL160C 1254 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YIR043CYIR043C 693 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YAL064WYAL064W 285 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 BLS1YLR408C 369 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YML094C-AYML094C-A 402 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 TLG2YOL018C 1194 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YFL052WYFL052W 1398 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 PRP9YDL030W 1593 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 TAT2YOL020W 1779 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 RPN5YDL147W 1338 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 NBP2YDR162C 711 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 ADK2YER170W 678 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 DUO1YGL061C 744 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 YIL086CYIL086C 309 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 CCE1YKL011C 1062 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 AIM1YAL046C 357 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 LEU4YNL104C 1860 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 TEP1YNL128W 1305 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 AKR2YOR034C 2250 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 CBP6YBR120C 489 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-DR3Q12441 HFI1YPL254W 1467 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 ERG24YNL280C 1317 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YFT2YDR319C 825 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 LSM5YER146W 282 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YOL162WYOL162W 648 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 RPN8YOR261C 1017 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 TIP41YPR040W 1071 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 AAC3YBR085W 924 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 IFA38YBR159W 1044 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 DRN1YGR093W 1524 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YFR057WYFR057W 456 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 NPP2YEL016C 1482 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YPR084WYPR084W 1371 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 FIP1YJR093C 984 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YNL134CYNL134C 1131 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 RPC31YNL151C 756 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YOR062CYOR062C 807 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 GPI2YPL076W 843 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 PPT1YGR123C 1542 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 NFI1YOR156C 2181 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YEA6YEL006W 1008 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YLL059CYLL059C 507 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YNL217WYNL217W 981 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 MPM1YJL066C 759 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 MRPL15YLR312W-A 762 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 JNM1YMR294W 1122 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 RTG1YOL067C 534 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YOL166CYOL166C 339 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 SCP1YOR367W 603 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YPR027CYPR027C 834 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 SEC61YLR378C 1443 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 RRI1YDL216C 1323 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 TPN1YGL186C 1740 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 KSS1YGR040W 1107 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 ERP2YAL007C 648 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YLR046CYLR046C 813 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YLR162WYLR162W 357 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 SMM1YNR015W 1155 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-DR3Q12441 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 BUD26YDR241W 288 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 SAM2YDR502C 1155 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 HPM1YIL110W 1134 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 MRPL8YJL063C 717 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 RBG1YAL036C 1110 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 RFA2YNL312W 822 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 RRP36YOR287C 903 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 MSF1YPR047W 1410 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 MIF2YKL089W 1650 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 FUB1YCR076C 753 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 GRX6YDL010W 696 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YDL119CYDL119C 924 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 MET28YIR017C 564 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 PSY3YLR376C 729 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 IES2YNL215W 963 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 SFT2YBL102W 648 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 STE4YOR212W 1272 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 SLI1YGR212W 1407 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 ALP1YNL270C 1722 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 ARH1YDR376W 1482 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 POP2YNR052C 1302 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 HXT11YOL156W 1704 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 PTM1YKL039W 1572 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 MRPL6YHR147C 645 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YLL017WYLL017W 312 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YLR365WYLR365W 333 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 SEC65YML105C 822 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 MDM12YOL009C 816 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YPL136WYPL136W 369 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YPR177CYPR177C 372 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 GNP1YDR508C 1992 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 TRP2YER090W 1524 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 PCL2YDL127W 927 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YFL012WYFL012W 447 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YNL174WYNL174W 573 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 EFM2YBR271W 1260 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 YDR124WYDR124W 975 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 NMA2YGR010W 1188 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 EST3YIL009C-A 546 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-DR3Q12441 URA5YML106W 681 nt7.54□□□□□ -1.2
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