Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 GAL2YLR081W 1725 nt7.96□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 LCL3YGL085W 825 nt7.96□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 ORM1YGR038W 669 nt7.96□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 YBL081WYBL081W 1107 nt7.96□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 FIT1YDR534C 1587 nt7.96□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 FMP40YPL222W 2067 nt7.96□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 YPR150WYPR150W 522 nt7.95□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 TGL5YOR081C 2250 nt7.94□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 MMS21YEL019C 804 nt7.94□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.94□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 COS6YGR295C 1146 nt7.94□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 YLR463CYLR463C 552 nt7.94□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 TOK1YJL093C 2076 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 RRP1YDR087C 837 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 CCW12YLR110C 402 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 CYT1YOR065W 930 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 PRE2YPR103W 864 nt7.93□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 YMR252CYMR252C 405 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 ASR1YPR093C 867 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 CIT2YCR005C 1383 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 WSC4YHL028W 1818 nt7.92□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 RPL2BYIL018W 765 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 MRPS18YNL306W 654 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 HIS3YOR202W 663 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 AOS1YPR180W 1044 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 MPE1YKL059C 1326 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 SAL1YNL083W 1485 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 ECM27YJR106W 2178 nt7.91□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 YIP4YGL198W 708 nt7.9□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 YHR033WYHR033W 1272 nt7.9□□□□□ -1.14
YLR225CQ05948 UBP13YBL067C 2244 nt7.9□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 MTO1YGL236C 2010 nt7.9□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 HAM1YJR069C 594 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 SLD7YOR060C 774 nt7.89□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 HTZ1YOL012C 405 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 AIM41YOR215C 558 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 FSF1YOR271C 984 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 RRP9YPR137W 1722 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 CRH1YGR189C 1524 nt7.88□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 INM1YHR046C 888 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 TAF9YMR236W 474 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 RTC4YNL254C 1206 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 SGV1YPR161C 1974 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 HXK1YFR053C 1458 nt7.87□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 COQ3YOL096C 939 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 YPC1YBR183W 951 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 TRP2YER090W 1524 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 BDS1YOL164W 1941 nt7.86□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 NUP57YGR119C 1626 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 ATG23YLR431C 1362 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 TFG2YGR005C 1203 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 YHR140WYHR140W 720 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 DAL80YKR034W 810 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 RNH201YNL072W 924 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 OSW2YLR054C 2175 nt7.85□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 MTC6YHR151C 1581 nt7.84□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 PLB2YMR006C 2121 nt7.84□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 ASF1YJL115W 840 nt7.84□□□□□ -1.15
YLR225CQ05948 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 APE4YHR113W 1473 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YML018CYML018C 1182 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YNL092WYNL092W 1203 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 ORT1YOR130C 879 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 MOD5YOR274W 1287 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 ALD5YER073W 1563 nt7.83□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YLR072WYLR072W 2082 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 GCG1YER163C 699 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 FPR3YML074C 1236 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 GAT1YFL021W 1533 nt7.82□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 TAF11YML015C 1041 nt7.81□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YNL140CYNL140C 570 nt7.81□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 LSC1YOR142W 990 nt7.81□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 ADE16YLR028C 1776 nt7.81□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 PEX28YHR150W 1740 nt7.81□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YER147C-AYER147C-A 411 nt7.8□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YNR005CYNR005C 405 nt7.8□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 OST3YOR085W 1053 nt7.8□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YIL177CYIL177C 5277 nt7.8□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 BNA3YJL060W 1335 nt7.79□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 ABP1YCR088W 1779 nt7.79□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 snR78snR78 87 nt7.79□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 FMO1YHR176W 1299 nt7.79□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 ELP6YMR312W 822 nt7.79□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 MRN1YPL184C 1839 nt7.79□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YHP1YDR451C 1062 nt7.78□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 YEL074WYEL074W 339 nt7.78□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 CDC1YDR182W 1476 nt7.78□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 CIT3YPR001W 1461 nt7.78□□□□□ -1.16
YLR225CQ05948 PRE3YJL001W 648 nt7.77□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 TAF4YMR005W 1167 nt7.77□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 YMR122CYMR122C 375 nt7.77□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 YOR300WYOR300W 309 nt7.77□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 TDH2YJR009C 999 nt7.76□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 LEA1YPL213W 717 nt7.76□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 CDS1YBR029C 1374 nt7.75□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 THI6YPL214C 1623 nt7.75□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 CDC10YCR002C 969 nt7.75□□□□□ -1.17
YLR225CQ05948 YDL144CYDL144C 1071 nt7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms