Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAP1Q01518 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAP1Q01518 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAP1Q01518 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAP1Q01518 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms