Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN5P54829 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN5P54829 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN5P54829 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN5P54829 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms