Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AP2S1P53680 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP2S1P53680 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AP2S1P53680 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AP2S1P53680 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP2S1P53680 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP2S1P53680 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP2S1P53680 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AP2S1P53680 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP2S1P53680 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AP2S1P53680 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms