Protein–RNA interactions for Protein: P51608

MECP2, Methyl-CpG-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MECP2P51608 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MECP2P51608 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MECP2P51608 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MECP2P51608 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MECP2P51608 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MECP2P51608 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MECP2P51608 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MECP2P51608 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MECP2P51608 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MECP2P51608 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MECP2P51608 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MECP2P51608 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MECP2P51608 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MECP2P51608 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MECP2P51608 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MECP2P51608 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MECP2P51608 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MECP2P51608 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MECP2P51608 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MECP2P51608 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MECP2P51608 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MECP2P51608 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MECP2P51608 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MECP2P51608 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MECP2P51608 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MECP2P51608 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MECP2P51608 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MECP2P51608 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MECP2P51608 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MECP2P51608 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MECP2P51608 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MECP2P51608 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MECP2P51608 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MECP2P51608 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MECP2P51608 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MECP2P51608 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MECP2P51608 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MECP2P51608 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MECP2P51608 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MECP2P51608 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MECP2P51608 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MECP2P51608 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MECP2P51608 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MECP2P51608 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MECP2P51608 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MECP2P51608 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MECP2P51608 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MECP2P51608 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MECP2P51608 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MECP2P51608 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MECP2P51608 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MECP2P51608 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MECP2P51608 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MECP2P51608 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MECP2P51608 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MECP2P51608 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MECP2P51608 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MECP2P51608 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MECP2P51608 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MECP2P51608 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MECP2P51608 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MECP2P51608 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MECP2P51608 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MECP2P51608 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MECP2P51608 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MECP2P51608 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MECP2P51608 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MECP2P51608 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MECP2P51608 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MECP2P51608 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MECP2P51608 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MECP2P51608 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MECP2P51608 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MECP2P51608 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MECP2P51608 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MECP2P51608 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MECP2P51608 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MECP2P51608 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MECP2P51608 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MECP2P51608 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MECP2P51608 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MECP2P51608 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MECP2P51608 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MECP2P51608 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms