Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VEGFCP49767 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VEGFCP49767 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VEGFCP49767 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VEGFCP49767 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VEGFCP49767 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFCP49767 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFCP49767 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFCP49767 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFCP49767 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VEGFCP49767 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFCP49767 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFCP49767 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFCP49767 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VEGFCP49767 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VEGFCP49767 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFCP49767 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFCP49767 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFCP49767 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VEGFCP49767 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFCP49767 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VEGFCP49767 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms