Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT5P48643 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT5P48643 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCT5P48643 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCT5P48643 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCT5P48643 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT5P48643 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT5P48643 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT5P48643 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT5P48643 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT5P48643 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT5P48643 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT5P48643 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT5P48643 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT5P48643 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT5P48643 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT5P48643 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT5P48643 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT5P48643 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT5P48643 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT5P48643 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT5P48643 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT5P48643 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT5P48643 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT5P48643 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT5P48643 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT5P48643 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT5P48643 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT5P48643 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT5P48643 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT5P48643 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT5P48643 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT5P48643 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT5P48643 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT5P48643 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT5P48643 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT5P48643 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT5P48643 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT5P48643 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT5P48643 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT5P48643 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT5P48643 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT5P48643 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT5P48643 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT5P48643 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT5P48643 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT5P48643 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT5P48643 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT5P48643 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT5P48643 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT5P48643 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT5P48643 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT5P48643 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT5P48643 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT5P48643 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT5P48643 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT5P48643 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT5P48643 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT5P48643 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT5P48643 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT5P48643 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT5P48643 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT5P48643 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT5P48643 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT5P48643 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT5P48643 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT5P48643 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT5P48643 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT5P48643 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT5P48643 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT5P48643 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT5P48643 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT5P48643 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT5P48643 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT5P48643 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT5P48643 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT5P48643 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT5P48643 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT5P48643 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT5P48643 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT5P48643 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT5P48643 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT5P48643 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT5P48643 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT5P48643 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT5P48643 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT5P48643 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT5P48643 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCT5P48643 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT5P48643 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCT5P48643 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms