Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA7P36544 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNA7P36544 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms