Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SERPINB3P29508 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SERPINB3P29508 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SERPINB3P29508 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SERPINB3P29508 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms