Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPHA3P29320 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHA3P29320 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHA3P29320 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA3P29320 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms