Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLNP26678 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLNP26678 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLNP26678 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLNP26678 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLNP26678 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLNP26678 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLNP26678 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLNP26678 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLNP26678 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLNP26678 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLNP26678 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLNP26678 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLNP26678 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLNP26678 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLNP26678 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLNP26678 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLNP26678 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLNP26678 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLNP26678 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLNP26678 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLNP26678 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLNP26678 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLNP26678 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLNP26678 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLNP26678 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLNP26678 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLNP26678 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLNP26678 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLNP26678 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLNP26678 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLNP26678 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLNP26678 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLNP26678 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLNP26678 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLNP26678 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLNP26678 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLNP26678 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLNP26678 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLNP26678 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PLNP26678 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLNP26678 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLNP26678 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLNP26678 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLNP26678 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLNP26678 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PLNP26678 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PLNP26678 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms