Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TRHP20396 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRHP20396 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRHP20396 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRHP20396 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TRHP20396 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
TRHP20396 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRHP20396 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRHP20396 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRHP20396 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRHP20396 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRHP20396 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRHP20396 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TRHP20396 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TRHP20396 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TRHP20396 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TRHP20396 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
TRHP20396 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
TRHP20396 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC40.05■■■■■ 4
TRHP20396 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.05■■■■■ 4
TRHP20396 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
TRHP20396 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
TRHP20396 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC40.04■■■■■ 4
TRHP20396 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
TRHP20396 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.04■■■■■ 4
TRHP20396 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
TRHP20396 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TRHP20396 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TRHP20396 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TRHP20396 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
TRHP20396 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC40.02■■■■■ 4
TRHP20396 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.02■■■■■ 4
TRHP20396 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TRHP20396 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TRHP20396 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40■■■■□ 3.99
TRHP20396 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
TRHP20396 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRHP20396 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRHP20396 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRHP20396 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TRHP20396 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
TRHP20396 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
TRHP20396 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TRHP20396 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TRHP20396 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
TRHP20396 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TRHP20396 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
TRHP20396 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TRHP20396 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
TRHP20396 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
TRHP20396 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TRHP20396 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TRHP20396 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TRHP20396 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TRHP20396 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TRHP20396 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TRHP20396 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TRHP20396 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
TRHP20396 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TRHP20396 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
TRHP20396 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TRHP20396 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRHP20396 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
TRHP20396 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
TRHP20396 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRHP20396 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRHP20396 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRHP20396 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
TRHP20396 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRHP20396 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRHP20396 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRHP20396 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TRHP20396 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TRHP20396 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TRHP20396 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TRHP20396 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
TRHP20396 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TRHP20396 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TRHP20396 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TRHP20396 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TRHP20396 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TRHP20396 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRHP20396 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRHP20396 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRHP20396 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRHP20396 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
TRHP20396 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
TRHP20396 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
TRHP20396 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
TRHP20396 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
TRHP20396 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TRHP20396 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms