Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA2P02652 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA2P02652 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA2P02652 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOA2P02652 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA2P02652 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA2P02652 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA2P02652 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA2P02652 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA2P02652 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA2P02652 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOA2P02652 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA2P02652 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA2P02652 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA2P02652 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOA2P02652 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA2P02652 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA2P02652 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA2P02652 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA2P02652 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA2P02652 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOA2P02652 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA2P02652 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA2P02652 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA2P02652 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA2P02652 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA2P02652 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOA2P02652 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOA2P02652 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA2P02652 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOA2P02652 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA2P02652 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA2P02652 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOA2P02652 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA2P02652 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOA2P02652 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA2P02652 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA2P02652 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA2P02652 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA2P02652 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA2P02652 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOA2P02652 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOA2P02652 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOA2P02652 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA2P02652 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA2P02652 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA2P02652 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA2P02652 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOA2P02652 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA2P02652 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA2P02652 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA2P02652 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOA2P02652 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOA2P02652 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms