Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEC24BO95487 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEC24BO95487 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SEC24BO95487 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC24BO95487 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC24BO95487 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms