Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX4O60224 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX4O60224 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX4O60224 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX4O60224 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX4O60224 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX4O60224 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX4O60224 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX4O60224 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX4O60224 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX4O60224 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX4O60224 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX4O60224 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX4O60224 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX4O60224 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSX4O60224 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSX4O60224 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX4O60224 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX4O60224 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX4O60224 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX4O60224 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSX4O60224 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX4O60224 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX4O60224 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX4O60224 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX4O60224 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX4O60224 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX4O60224 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX4O60224 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSX4O60224 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX4O60224 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX4O60224 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX4O60224 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSX4O60224 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX4O60224 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX4O60224 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX4O60224 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX4O60224 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX4O60224 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX4O60224 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX4O60224 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX4O60224 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX4O60224 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX4O60224 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSX4O60224 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX4O60224 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX4O60224 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX4O60224 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX4O60224 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX4O60224 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX4O60224 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX4O60224 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX4O60224 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX4O60224 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX4O60224 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX4O60224 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX4O60224 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSX4O60224 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX4O60224 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX4O60224 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX4O60224 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX4O60224 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX4O60224 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX4O60224 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX4O60224 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX4O60224 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX4O60224 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX4O60224 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX4O60224 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX4O60224 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX4O60224 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX4O60224 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX4O60224 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX4O60224 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX4O60224 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX4O60224 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX4O60224 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX4O60224 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX4O60224 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX4O60224 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX4O60224 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX4O60224 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms