Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRTM2O43300 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM2O43300 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms