Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFXAPO00287 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFXAPO00287 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFXAPO00287 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFXAPO00287 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFXAPO00287 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms