Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCSO14618 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCSO14618 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCSO14618 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCSO14618 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCSO14618 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCSO14618 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCSO14618 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCSO14618 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCSO14618 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCSO14618 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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