Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 DDX42-218ENST00000584261 510 ntTSL 36.25□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DDX42-206ENST00000578137 857 ntTSL 36.16□□□□□ -1.422e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ATP6V1E1-205ENST00000460085 558 ntTSL 26.11□□□□□ -1.432e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DDX42-209ENST00000579511 594 ntTSL 56.11□□□□□ -1.432e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TRIM25-206ENST00000572550 519 ntTSL 55.84□□□□□ -1.472e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 ATP6V1E1-204ENST00000413576 800 ntTSL 35.5□□□□□ -1.532e-11■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 ATP6V1E1-209ENST00000484653 747 ntTSL 55.35□□□□□ -1.552e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.34□□□□□ -1.552e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 DDX42-205ENST00000577978 581 ntTSL 55.02□□□□□ -1.612e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 PRKCSH-214ENST00000591946 569 ntTSL 24.42□□□□□ -1.72e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 NCOR1-206ENST00000411510 1883 ntTSL 1 (best)20.82■□□□□ 0.921e-16■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 NCOR1-221ENST00000582357 1877 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.621e-16■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPL27-208ENST00000593262 1872 ntTSL 218.33■□□□□ 0.532e-11■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 DPF2-208ENST00000531989 1573 ntTSL 315.96■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-11■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 TUBA1B-201ENST00000332858 3198 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.462e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 YME1L1-207ENST00000477432 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 8.9
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PUM1Q14671 GAS8-209ENST00000564802 470 ntTSL 310.06□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GAS8-214ENST00000566266 3174 ntTSL 1 (best)10.04□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DPF2-201ENST00000252268 2462 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.842e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 IMPDH2-203ENST00000442157 865 ntTSL 29.77□□□□□ -0.852e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 YME1L1-209ENST00000613434 4127 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 GAS8-219ENST00000569558 3856 ntTSL 29.54□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPL27-202ENST00000586277 460 ntTSL 39.49□□□□□ -0.892e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DPF2-209ENST00000532052 3165 ntTSL 28.89□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DPF2-210ENST00000532102 524 ntTSL 48.89□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPL27-204ENST00000588830 318 ntTSL 28.08□□□□□ -1.122e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DPF2-204ENST00000524666 4840 ntTSL 28.07□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-219ENST00000528179 560 ntTSL 57.95□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 IPO8-203ENST00000535598 758 ntTSL 37.82□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-223ENST00000530148 664 ntTSL 47.61□□□□□ -1.192e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.232e-11■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SENP6-209ENST00000485497 941 ntTSL 47.14□□□□□ -1.272e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 WDHD1-204ENST00000475379 696 ntTSL 27.02□□□□□ -1.292e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.32e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SNX2-212ENST00000514030 823 ntTSL 36.8□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SNX2-204ENST00000506847 798 ntTSL 56.65□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 DPF2-211ENST00000532264 726 ntTSL 56.65□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-233ENST00000639623 3395 ntTSL 56.42□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 CCDC88A-212ENST00000474059 541 ntTSL 56.38□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■□□□□ 8.9
PUM1Q14671 SNX2-208ENST00000509281 579 ntTSL 36.26□□□□□ -1.412e-6■□□□□ 8.9
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