Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CGGBP1Q9UFW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CGGBP1Q9UFW8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms