Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms