Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.293e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.973e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 JPT1-201ENST00000304834 1633 ntTSL 1 (best)20.89■□□□□ 0.933e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 UBC-208ENST00000540700 627 ntTSL 220.66■□□□□ 0.93e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 JPT1-210ENST00000580380 411 ntTSL 518.44■□□□□ 0.543e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 MCM3-206ENST00000596983 559 ntTSL 318.26■□□□□ 0.513e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 JPT1-207ENST00000481094 382 ntTSL 517.66■□□□□ 0.423e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 UBC-203ENST00000535859 582 ntTSL 217.24■□□□□ 0.353e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.243e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 UBC-212ENST00000544481 477 ntTSL 415.79■□□□□ 0.123e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 JPT1-208ENST00000481647 576 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.043e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 UBC-214ENST00000546271 559 ntTSL 414.82□□□□□ -0.043e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.753e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 UBAP2L-210ENST00000441890 678 ntTSL 221.29■■□□□ 18e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 RPL11-205ENST00000482370 879 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.642e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 U2AF2-205ENST00000588850 637 ntTSL 218.91■□□□□ 0.624e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 317.54■□□□□ 0.44e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 UQCRC2-208ENST00000565464 929 ntTSL 511.16□□□□□ -0.629e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 SMARCB1-205ENST00000417137 889 ntTSL 328.65■■■□□ 2.188e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PRPSAP1-205ENST00000442767 908 ntTSL 528.54■■■□□ 2.168e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.12e-7■□□□□ 9
G3BP1Q13283 DPYSL2-203ENST00000493789 562 ntTSL 427.42■■□□□ 1.982e-9■□□□□ 9
G3BP1Q13283 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 326.88■■□□□ 1.898e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.868e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.848e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.838e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 GART-210ENST00000441403 715 ntTSL 326.17■■□□□ 1.785e-8■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.02■■□□□ 1.68e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.598e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.588e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PMPCB-205ENST00000453466 1509 ntTSL 524.75■■□□□ 1.558e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.538e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PRPSAP1-204ENST00000436498 1003 ntTSL 324.46■■□□□ 1.518e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.498e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 FN3K-204ENST00000573841 513 ntTSL 224.21■■□□□ 1.478e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.462e-7■□□□□ 9
G3BP1Q13283 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.458e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 TJP2-205ENST00000423935 614 ntTSL 223.48■■□□□ 1.358e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.328e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-205ENST00000423941 583 ntTSL 422.89■■□□□ 1.258e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-202ENST00000376610 736 ntTSL 522.82■■□□□ 1.248e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-208ENST00000438518 610 ntTSL 422.8■■□□□ 1.248e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 STRN4-215ENST00000597063 570 ntTSL 422.5■■□□□ 1.198e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 522.44■■□□□ 1.188e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PMPCB-204ENST00000444457 2385 ntTSL 222.43■■□□□ 1.188e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.168e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.128e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.18e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.18e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 AHR-202ENST00000463496 4820 ntTSL 1 (best)21.92■■□□□ 1.18e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.068e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.052e-7■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PMPCB-206ENST00000456433 904 ntTSL 521.18■□□□□ 0.988e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.948e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.948e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.938e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 MRPS18A-203ENST00000427312 803 ntTSL 1 (best)20.61■□□□□ 0.898e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.888e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.888e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-244ENST00000555650 1588 ntTSL 220.54■□□□□ 0.888e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.878e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PRPSAP1-202ENST00000423915 549 ntTSL 420.48■□□□□ 0.878e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 ACADVL-225ENST00000581378 752 ntTSL 320.17■□□□□ 0.822e-9■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.788e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-271ENST00000557353 1919 ntTSL 219.74■□□□□ 0.758e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.738e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.728e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 MCFD2-217ENST00000493804 807 ntTSL 219.48■□□□□ 0.718e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.678e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.668e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.658e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.658e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.638e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.618e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.568e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.558e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 WBP2-211ENST00000589642 568 ntTSL 318.38■□□□□ 0.538e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 METTL7A-204ENST00000550097 1846 ntTSL 518.3■□□□□ 0.528e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-224ENST00000481929 591 ntTSL 418.27■□□□□ 0.528e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-214ENST00000465269 1139 ntTSL 1 (best)18.24■□□□□ 0.518e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-204ENST00000376643 907 ntTSL 518.21■□□□□ 0.518e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 FN3K-202ENST00000570734 2515 ntTSL 518■□□□□ 0.478e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.468e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.458e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-213ENST00000462730 1999 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.438e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 HDAC6-206ENST00000426196 882 ntTSL 317.33■□□□□ 0.368e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.358e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.318e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PEX19-211ENST00000533104 544 ntTSL 416.86■□□□□ 0.298e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.268e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PEX19-208ENST00000532508 1237 ntTSL 516.68■□□□□ 0.268e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.248e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.238e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 PMPCB-203ENST00000443722 1323 ntTSL 516.4■□□□□ 0.228e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 NDRG2-258ENST00000556716 2718 ntTSL 216.22■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 WBP2-202ENST00000416574 987 ntTSL 216.21■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 9
G3BP1Q13283 METTL7A-202ENST00000547104 1825 ntTSL 1 (best)16.09■□□□□ 0.178e-6■□□□□ 9
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 471.8 ms