RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441403.1

GART-210, Transcript of phosphoribosylglycinamide formyltransferase, phosphoribosylglycinamide synthetase, phosphoribosylaminoimidazole synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene GART, Length 715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GART-210ENST00000441403 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.67■■■■■ 5.86
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GART-210ENST00000441403 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.89■■■■■ 4.62
GART-210ENST00000441403 NACADO15069 1562 aa43.66■■■■■ 4.58
GART-210ENST00000441403 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.61■■■■■ 4.57
GART-210ENST00000441403 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.13■■■■■ 4.5
GART-210ENST00000441403 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
GART-210ENST00000441403 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.86■■■■■ 4.45
GART-210ENST00000441403 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.81■■■■■ 4.44
GART-210ENST00000441403 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.8■■■■■ 4.44
GART-210ENST00000441403 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.7■■■■■ 4.43
GART-210ENST00000441403 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.52■■■■■ 4.4
GART-210ENST00000441403 SCRIBQ14160 1630 aa42.15■■■■■ 4.34
GART-210ENST00000441403 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.04■■■■■ 4.32
GART-210ENST00000441403 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.51■■■■■ 4.23
GART-210ENST00000441403 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
GART-210ENST00000441403 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.38■■■■■ 4.21
GART-210ENST00000441403 NCAPD3P42695 1498 aa40.29■■■■■ 4.04
GART-210ENST00000441403 SMARCA4P51532 1647 aa40.23■■■■■ 4.03
GART-210ENST00000441403 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.21■■■■■ 4.03
GART-210ENST00000441403 SMARCA2P51531 1590 aa40.14■■■■■ 4.02
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GART-210ENST00000441403 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.8■■■■□ 3.96
GART-210ENST00000441403 ERCC6Q03468 1493 aa39.72■■■■□ 3.95
GART-210ENST00000441403 NESP48681 1621 aa39.53■■■■□ 3.92
GART-210ENST00000441403 CUX2O14529 1486 aa39.5■■■■□ 3.91
GART-210ENST00000441403 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.34■■■■□ 3.89
GART-210ENST00000441403 WIZO95785 1651 aa39.34■■■■□ 3.89
GART-210ENST00000441403 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.15■■■■□ 3.86
GART-210ENST00000441403 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.14■■■■□ 3.86
GART-210ENST00000441403 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.11■■■■□ 3.85
GART-210ENST00000441403 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
GART-210ENST00000441403 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
GART-210ENST00000441403 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.03■■■■□ 3.84
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GART-210ENST00000441403 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.76■■■■□ 3.8
GART-210ENST00000441403 CFTRP13569 1480 aa38.7■■■■□ 3.79
GART-210ENST00000441403 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.68■■■■□ 3.78
GART-210ENST00000441403 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.66■■■■□ 3.78
GART-210ENST00000441403 WDR62O43379 1518 aa38.62■■■■□ 3.77
GART-210ENST00000441403 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.45■■■■□ 3.75
GART-210ENST00000441403 PRDM2Q13029 1718 aa38.31■■■■□ 3.72
GART-210ENST00000441403 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
GART-210ENST00000441403 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
GART-210ENST00000441403 TOPBP1Q92547 1522 aa37.94■■■■□ 3.66
GART-210ENST00000441403 ABCC8Q09428 1581 aa37.93■■■■□ 3.66
GART-210ENST00000441403 IFT140Q96RY7 1462 aa37.9■■■■□ 3.66
GART-210ENST00000441403 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.83■■■■□ 3.65
GART-210ENST00000441403 OSCARQ8IYS5 282 aa37.8■■■■□ 3.64
GART-210ENST00000441403 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.63
GART-210ENST00000441403 TRIM41Q8WV44 630 aa37.6■■■■□ 3.61
GART-210ENST00000441403 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
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GART-210ENST00000441403 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
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GART-210ENST00000441403 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.43■■■■□ 3.58
GART-210ENST00000441403 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.39■■■■□ 3.58
GART-210ENST00000441403 CUX1P39880 1505 aa37.37■■■■□ 3.57
GART-210ENST00000441403 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
GART-210ENST00000441403 FBLN2P98095 1184 aa37.27■■■■□ 3.56
GART-210ENST00000441403 WDR97A6NE52 1622 aa37.24■■■■□ 3.55
GART-210ENST00000441403 CHD1O14646 1710 aa37.22■■■■□ 3.55
GART-210ENST00000441403 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.19■■■■□ 3.54
GART-210ENST00000441403 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.19■■■■□ 3.54
GART-210ENST00000441403 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.19■■■■□ 3.54
GART-210ENST00000441403 ARHGEF11O15085 1522 aa37.11■■■■□ 3.53
GART-210ENST00000441403 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.11■■■■□ 3.53
GART-210ENST00000441403 GRIN2BQ13224 1484 aa37.08■■■■□ 3.53
GART-210ENST00000441403 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
GART-210ENST00000441403 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
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GART-210ENST00000441403 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.98■■■■□ 3.51
GART-210ENST00000441403 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.93■■■■□ 3.5
GART-210ENST00000441403 PBRM1Q86U86 1689 aa36.91■■■■□ 3.5
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GART-210ENST00000441403 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.9■■■■□ 3.5
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GART-210ENST00000441403 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.86■■■■□ 3.49
GART-210ENST00000441403 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.86■■■■□ 3.49
GART-210ENST00000441403 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.8■■■■□ 3.48
GART-210ENST00000441403 ARAP1Q96P48 1450 aa36.75■■■■□ 3.47
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GART-210ENST00000441403 ADAMTS12P58397 1594 aa36.57■■■■□ 3.45
GART-210ENST00000441403 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.54■■■■□ 3.44
GART-210ENST00000441403 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.53■■■■□ 3.44
GART-210ENST00000441403 NUP160Q12769 1436 aa36.43■■■■□ 3.42
GART-210ENST00000441403 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
GART-210ENST00000441403 CEP170Q5SW79 1584 aa36.4■■■■□ 3.42
GART-210ENST00000441403 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.23■■■■□ 3.39
GART-210ENST00000441403 KIF27Q86VH2 1401 aa36.23■■■■□ 3.39
GART-210ENST00000441403 SHROOM2Q13796 1616 aa36.21■■■■□ 3.39
GART-210ENST00000441403 IGF1RP08069 1367 aa36.15■■■■□ 3.38
GART-210ENST00000441403 JPH4Q96JJ6 628 aa36.13■■■■□ 3.37
GART-210ENST00000441403 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
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