Protein–RNA interactions for Protein: R4GMX3

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3-BMI1R4GMX3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COMMD3-BMI1R4GMX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD3-BMI1R4GMX3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD3-BMI1R4GMX3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms