Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC1Q9Y5R8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC1Q9Y5R8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms