Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCDHB6Q9Y5E3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB6Q9Y5E3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDHB6Q9Y5E3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB6Q9Y5E3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB6Q9Y5E3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms