Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTLL3Q9Y4R7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TTLL3Q9Y4R7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTLL3Q9Y4R7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms