Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 ARVCF-209ENST00000487793 863 ntTSL 220.74■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 30.1
DDX52Q9Y2R4 ARVCF-210ENST00000492625 631 ntTSL 316.93■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 30.1
DDX52Q9Y2R4 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 225.41■■□□□ 1.663e-6■■■■■ 30.1
DDX52Q9Y2R4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 30
DDX52Q9Y2R4 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 531.97■■■□□ 2.715e-6■■■■■ 30
DDX52Q9Y2R4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.632e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 TPM4-204ENST00000586499 708 ntTSL 422.65■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 221.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 TPM4-205ENST00000586833 558 ntTSL 516.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 TPM4-210ENST00000588507 367 ntTSL 37.84□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.12■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 RASA3-202ENST00000542651 975 ntTSL 517.11■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 415.02■□□□□ -02e-9■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 311.47□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 410.34□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.536e-7■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 325■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 425■■□□□ 1.592e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 321.16■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 520.04■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 219.87■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 219.11■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 213.71□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 320.4■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 520.4■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 29.8
DDX52Q9Y2R4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 29.7
DDX52Q9Y2R4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 29.7
DDX52Q9Y2R4 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 520.51■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 29.7
DDX52Q9Y2R4 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 36.03□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 29.7
DDX52Q9Y2R4 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 521.39■■□□□ 1.019e-8■■■■■ 29.5
DDX52Q9Y2R4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.989e-8■■■■■ 29.5
DDX52Q9Y2R4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.49e-8■■■■■ 29.5
DDX52Q9Y2R4 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.859e-8■■■■■ 29.5
DDX52Q9Y2R4 HNRNPK-207ENST00000472778 822 ntTSL 37.58□□□□□ -1.29e-8■■■■■ 29.5
DDX52Q9Y2R4 HNRNPK-209ENST00000483135 900 ntTSL 27.58□□□□□ -1.29e-8■■■■■ 29.5
DDX52Q9Y2R4 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.121e-24■■■■■ 29.4
DDX52Q9Y2R4 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 427.16■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 29.2
DDX52Q9Y2R4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 29.2
DDX52Q9Y2R4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 29.2
DDX52Q9Y2R4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 29.2
DDX52Q9Y2R4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 29.2
DDX52Q9Y2R4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 29.2
DDX52Q9Y2R4 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 29.2
DDX52Q9Y2R4 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 317.18■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 29.2
DDX52Q9Y2R4 CTBP1-206ENST00000504784 418 ntTSL 316.9■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 28.9
DDX52Q9Y2R4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 28.9
DDX52Q9Y2R4 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 28.9
DDX52Q9Y2R4 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 222.63■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 28.9
DDX52Q9Y2R4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.153e-6■■■■■ 28.9
DDX52Q9Y2R4 TGFB1-203ENST00000598758 559 ntTSL 511.06□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 28.7
DDX52Q9Y2R4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.84e-8■■■■■ 28.7
DDX52Q9Y2R4 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 510.62□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 28.7
DDX52Q9Y2R4 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.014e-8■■■■■ 28.7
DDX52Q9Y2R4 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 53.68□□□□□ -1.824e-8■■■■■ 28.7
DDX52Q9Y2R4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 325.68■■□□□ 1.79e-7■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.654e-7■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 FAM207A-203ENST00000458015 643 ntTSL 523.92■■□□□ 1.427e-7■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.424e-7■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 225.73■■□□□ 1.714e-6■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.364e-6■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.24e-6■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.994e-6■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 514.91□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 212.74□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.455e-9■■■■■ 28.6
DDX52Q9Y2R4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.935e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.845e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 216.05■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 GLG1-211ENST00000566601 2536 ntTSL 210.43□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 GLG1-207ENST00000563432 555 ntTSL 37.88□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 320.86■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 215.58■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 28.5
DDX52Q9Y2R4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.582e-6■■■■■ 28.4
DDX52Q9Y2R4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 28.4
DDX52Q9Y2R4 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 522.3■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 28.4
DDX52Q9Y2R4 CTBP1-210ENST00000510739 774 ntTSL 319■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 28.4
DDX52Q9Y2R4 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 313.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 418.62■□□□□ 0.574e-8■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.635e-6■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.635e-6■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 CORO1C-216ENST00000551059 474 ntTSL 222.28■■□□□ 1.165e-6■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 321.67■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 CORO1C-214ENST00000550542 1245 ntTSL 521.67■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 521.65■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-6■■■■■ 28.3
DDX52Q9Y2R4 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 411.49□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 28.3
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